В 1885 году в деревне Куфтыревская открылось Вохтомское земское трехклассное училище. Первый учитель Вохтомы – Клоковский Иван Иванович. ( С этого времени начинается народное образование Вохтомы).
В земской книге в разделе «Народное образование» записано следующее: «В волости существует три земских училища, одна церковно- приходская школа и три школы грамоты. Народное образование, хотя с каждым годом развивается, но особенного влечения не заметно, что можно заключить по малочисленности поступающих в школу мальчиков и часто до окончания полного курса его оставляющих. Девочки и совсем не поступают».
(Из отчета 1890 года: учащихся- 127 мальчиков, 21 девочка; 4 законоучителя, 5 учителей, 2 учительницы).
До 1929 года в деревнях Мелентьев Пал, Грехнев Пал, Куфтыревская работают четырехлетки.
С 1929 года на станции Фоминская открывается Вохтомская семилетняя
школа. За годы своего существования школа неоднократно меняла свое название: Вохтомская семилетняя, восьмилетняя, неполная средняя, основная общеобразовательная.
С 1 сентября 2004 года в здании начальных классов открыт детский сад "Росинка" структурное подразделение школы
С 2006 года муниципальное образовательное учреждение «Вохтомская основная общеобразовательная школа».
С 2011 года муниципальное бюджетное образовательное учреждение «Вохтомская основная общеобразовательная школа»
С 2015 года муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение «Вохтомская основная школа».
В 2022 году на основании Постановления администрации муниципального образования «Коношский муниципальный район» №280 от 31.05.2022 г. «О реорганизации муниципальных образовательных организаций», с 15 сентября 2022 года к муниципальному бюджетному общеобразовательному учреждению «Вохтомская основная школа» присоединены муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение «Волошская средняя школа» и муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение «Мелентьевская основная школа» как внешние структурные подразделения.
В 2024 году создан в рамках федерального проекта «Современная школа» национального проекта «Образование» Центр образования естественнонаучной и технологической направленностей «Точка роста».
Директора Вохтомской школы:
1929 – 1948гг. – Семёнов Николай Николаевич
Дмитриев Евгений Викентьевич
Титов Георгий Иванович
1948 – 1950 – Добрынин Евгений Александрович
1950 – 1955 – Кишкина Вера Федоровна
1955 – 1979 – Пепелышева Элеонора Евгеньевна
1979 – 1988 – Калинина Галина Ивановна
1988 – 1990 – Нефёдова Людмила Николаевна
1990 – 1996 – Сидоров Владимир Юрьевич
1996 – 2006 – Нефёдова Людмила Николаевна
2006 – 2010 - Сидорова Татьяна Сергеевна
С 11.11.2010 – Сидоров Владимир Юрьевич
24 года отработала директором школы Пепелышева Элеонора Евгеньевна.
После окончания Каргопольского педагогического училища Элеонора Евгеньевна была направлена в Вохтомскую семилетнюю школу. Заочно закончила Архангельский педагогический институт. С 1955 по 1979 год работала директором Вохтомской школы.
Награды: «Отличник народного образования»
«Заслуженный учитель РСФСР»